24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0932 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  100 
 
 		 394 aa  803    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  58.02 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  57.76 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  57.76 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  58.35 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  46.79 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  48.6 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  45.97 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  45.97 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  45.8 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  42.36 
 
 		 403 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.94 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  42.57 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.1 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  41.41 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  44.85 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.56 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  40.83 
 
 		 193 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30.62 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  27.89 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  29.6 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  29.79 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  29.41 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  24.88 
 
 		 346 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>