47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4812 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  100 
 
 
346 aa  696    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  28.93 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  27.78 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  30.79 
 
 
376 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  25.96 
 
 
363 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  27.86 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  34.1 
 
 
351 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  27.02 
 
 
383 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  27.02 
 
 
383 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  33.8 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  27.72 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  25 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2950  baseplate J family protein  26.58 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  25.27 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  29.28 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  30.88 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  27.46 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  30.15 
 
 
378 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  23.83 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  23.83 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  26.25 
 
 
366 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  27.78 
 
 
372 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  28.63 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  28.63 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  28.63 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  28 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  23.87 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  29.01 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  26.69 
 
 
360 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  27.03 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  25.66 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  29.33 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  22.62 
 
 
689 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  24.72 
 
 
374 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  24.7 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  23.9 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  28.1 
 
 
394 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  24.65 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  24.19 
 
 
359 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  24.19 
 
 
359 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  23.19 
 
 
410 aa  46.6  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1176  putative bacteriophage protein  37.14 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118784  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  28.02 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  26.38 
 
 
388 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  28.21 
 
 
377 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  24.88 
 
 
394 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  29.84 
 
 
1286 aa  42.7  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>