35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4482 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  100 
 
 		 366 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  40.79 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  34.7 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  36.6 
 
 		 347 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  30.21 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  31.78 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  35.37 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  33.44 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  33.44 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  33.12 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  33.02 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  32.77 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  27.54 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  33.19 
 
 		 249 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  27.03 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  29.44 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  25 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  27.87 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  26.25 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  25.45 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  25 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  32.78 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  23.85 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  23.85 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  23.85 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  25.38 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  28.57 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  30.3 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  28.49 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  25.75 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  25.75 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  27.08 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  26.7 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  27.09 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>