32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1162 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  100 
 
 		 347 aa  695    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  67.83 
 
 		 346 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  43.55 
 
 		 347 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  44.19 
 
 		 351 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  35.39 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  36 
 
 		 359 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  36 
 
 		 359 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  35.71 
 
 		 359 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  38.67 
 
 		 249 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  33.61 
 
 		 378 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  32.6 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  32.6 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  32.6 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  31.88 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  33.15 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  30.05 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  36.6 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  31.58 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  31.58 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  30.26 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  34.31 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  30.08 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  30.06 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  26.78 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  31.38 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  33.87 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  27.46 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  30.06 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  30.81 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  27.66 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  25.53 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2950  baseplate J family protein  25.86 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>