32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1870 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  100 
 
 
367 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  54.03 
 
 
386 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  44.59 
 
 
378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  44.33 
 
 
378 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  44.33 
 
 
378 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  44.06 
 
 
378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  42.93 
 
 
382 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  38.04 
 
 
363 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  37.23 
 
 
351 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  33.51 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  33.51 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  33.51 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  33.78 
 
 
346 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  31.54 
 
 
352 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  32.15 
 
 
347 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  32.2 
 
 
360 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  29.27 
 
 
347 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  34.83 
 
 
249 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  27.72 
 
 
372 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  28.04 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  28.23 
 
 
355 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  28.23 
 
 
355 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  29.37 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  27.82 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  26.8 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  28.72 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  26.1 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  27.1 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1449  hypothetical protein  43.75 
 
 
65 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  31.71 
 
 
390 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  22.56 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  22.56 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>