26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2444 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  100 
 
 		 370 aa  736    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  34.75 
 
 		 372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  37.54 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  35.33 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  35.33 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  35.02 
 
 		 359 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  38.85 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  34.83 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  33.33 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  34.31 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  30.12 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  35.37 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  29.97 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  28.97 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  27.68 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  26.6 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  26.6 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  26.6 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  30.16 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  27.66 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  29.14 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  26.89 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  26.89 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  26.45 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  28.84 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  35.43 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>