31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0564 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  100 
 
 		 363 aa  714    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  37.5 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  35.45 
 
 		 378 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  35.45 
 
 		 378 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  35.45 
 
 		 378 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  36.24 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  35.35 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  32.95 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  30.64 
 
 		 351 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  29.08 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  28.69 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  28.69 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  28.69 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  26.78 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  28.49 
 
 		 352 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  29.19 
 
 		 347 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  28.78 
 
 		 249 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  27.75 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  26.45 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  32.39 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  32.39 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  24.01 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  27.09 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  33.73 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  24.93 
 
 		 689 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  23.35 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  25 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  28.7 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  24.65 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  29.41 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  24.51 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>