16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2492 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  100 
 
 		 352 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  42.46 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  35.81 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  34.45 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2950  baseplate J family protein  35.11 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  31.45 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  31.45 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  30.4 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  27.78 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  29.63 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  24.04 
 
 		 360 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  35.48 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  28.7 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  31.93 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  27.42 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  27.4 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>