40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0185 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  100 
 
 		 353 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  44.16 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  32.46 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  30.5 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  29.23 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  30.29 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  30.15 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  31.38 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  30.16 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  28.88 
 
 		 376 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  27.57 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  32.77 
 
 		 386 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  27.79 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  27.79 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  25.95 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  27.27 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  27.27 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  34.8 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  29.12 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  25.75 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  30.61 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  27.35 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  32.41 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  33.33 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  25.66 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  30.04 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  27.87 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  33.73 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  28.8 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  28.8 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  28.8 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  24.83 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2950  baseplate J family protein  28.16 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  28.12 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0687  Phage Mu gp47 related protein  27.98 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0624  Phage Mu gp47 related protein  27.98 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  25.52 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  26.26 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  27.73 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  26.61 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>