36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0855 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  823    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  28.67 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1176  putative bacteriophage protein  30.1 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118784  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0817  putative bacteriophage protein  27.37 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1285  hypothetical protein  27.08 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1252  hypothetical protein  26.82 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1015  hypothetical protein  26.82 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.573023  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2820  hypothetical protein  27.78 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2200  hypothetical protein  26.52 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2410  putative bacteriophage protein  27.67 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3651  putative bacteriophage protein  28.11 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0414851  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1803  putative bacteriophage protein  25.95 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1242  hypothetical protein  27.05 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  27.13 
 
 
689 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2933  hypothetical protein  27.96 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4958  hypothetical protein  33.01 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  24.32 
 
 
605 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2245  putative bacteriophage protein  26.82 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.466176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  31.28 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  34.04 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  34.04 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0874  hypothetical protein  25.2 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  26.61 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  22.32 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  27.5 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  28.65 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  30.21 
 
 
389 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  25.39 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2928  hypothetical protein  23.97 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  26.79 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  31.54 
 
 
372 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  23.19 
 
 
346 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  26.97 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  26.97 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  25.14 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  23.4 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>