27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5069 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  49.22 
 
 
394 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  49.22 
 
 
394 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  49.22 
 
 
394 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  47.55 
 
 
394 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  45.97 
 
 
394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  44.87 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  44.68 
 
 
395 aa  356  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  44.9 
 
 
403 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  44.9 
 
 
402 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  44.59 
 
 
400 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  43.38 
 
 
387 aa  323  4e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  43.04 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.93 
 
 
384 aa  311  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  43.75 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  41.49 
 
 
399 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  43.33 
 
 
193 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  30.86 
 
 
389 aa  99.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  35.68 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  33.61 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  28.27 
 
 
689 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  34.04 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  25.44 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  27.84 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  27.56 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  26.57 
 
 
360 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>