20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1489 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  85.53 
 
 
403 aa  261  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  80 
 
 
402 aa  258  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  54.11 
 
 
396 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  43.33 
 
 
390 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  43.33 
 
 
390 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  40.83 
 
 
394 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  39.53 
 
 
395 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  37.98 
 
 
394 aa  99  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  38.46 
 
 
394 aa  99  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  37.01 
 
 
384 aa  95.5  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  37.01 
 
 
394 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  37.01 
 
 
394 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  37.8 
 
 
394 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  36.59 
 
 
399 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  38.76 
 
 
400 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  37.21 
 
 
400 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  35.25 
 
 
387 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  40 
 
 
387 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  38.24 
 
 
389 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>