26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0912 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  100 
 
 		 394 aa  815    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  64.12 
 
 		 394 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  64.63 
 
 		 394 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  64.38 
 
 		 394 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  58.35 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  47.46 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  44.87 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  44.87 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  40.8 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  40.65 
 
 		 403 aa  326  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  42.67 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  41.31 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  42.67 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  40.7 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.39 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  43.26 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  39.32 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  37.98 
 
 		 193 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  28.21 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30.17 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  34.5 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  23.9 
 
 		 689 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  23.57 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  28.95 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  27.64 
 
 		 605 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  25.14 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>