17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1546 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1171    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  27.51 
 
 		 689 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  32.06 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  28.62 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  27.56 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  32.68 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  24.32 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  27.89 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  31.85 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  30.26 
 
 		 396 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  33.01 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  31.52 
 
 		 377 aa  47  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  26.26 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  27.64 
 
 		 394 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3566  putative baseplate protein  37.5 
 
 		 266 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  26.02 
 
 		 374 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5764  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>