73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2907 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  100 
 
 		 377 aa  746    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  49.07 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  49.07 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  48.54 
 
 		 371 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  47.99 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  46.38 
 
 		 367 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  35.98 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  32.5 
 
 		 369 aa  179  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  32 
 
 		 374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  36.07 
 
 		 296 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  38.17 
 
 		 298 aa  99.8  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  34.95 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  34.95 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  34.41 
 
 		 297 aa  97.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  34.41 
 
 		 297 aa  97.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  37.1 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  35.48 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  35.48 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  35.48 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  35.48 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  36.56 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  35.48 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  24.05 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  32.79 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  28.65 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  35.48 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  30.6 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  38.17 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  35.64 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  35.64 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  33.33 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  31.72 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  31.18 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  31.79 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  31.18 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  35 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  34.78 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  33.33 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  33.95 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  31.55 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  33.95 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  30.11 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  30 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  31.22 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  33.51 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  30.52 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  31.06 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  29.03 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  31.01 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  34.18 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  30.77 
 
 		 285 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  31.1 
 
 		 285 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  35.64 
 
 		 289 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  30.77 
 
 		 285 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  31.02 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  31.03 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30.14 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  31.52 
 
 		 605 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  30.59 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  27.92 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  32.41 
 
 		 114 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  25.94 
 
 		 399 aa  46.2  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  25.85 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  25.85 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  28.81 
 
 		 796 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  23.4 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  25.42 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  28.21 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  27.07 
 
 		 656 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  25.57 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  27.88 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  32.72 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  28.5 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>