62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0233 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  100 
 
 
388 aa  766    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  24.37 
 
 
367 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  26.89 
 
 
302 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  27.54 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  23.66 
 
 
367 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  27.13 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  43.18 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  23.68 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  29.32 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  29.32 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  29.32 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  29.32 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  27.24 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  24.05 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  23.36 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  23.05 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  29.94 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  38.83 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  42.55 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  40.19 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  43.33 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  41.49 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  45.57 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  31.4 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  28.26 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  38.74 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  46.15 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  39.36 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  39.36 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  34.31 
 
 
302 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  36.84 
 
 
302 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  38.05 
 
 
305 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  38.05 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  38.05 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  30.06 
 
 
299 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  38.05 
 
 
302 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  38.05 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  37.76 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  37.23 
 
 
303 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  38.14 
 
 
302 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  38.14 
 
 
302 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  35.79 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  30.36 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  39.53 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  32.74 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  29.76 
 
 
302 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  38.71 
 
 
302 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  25.38 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  37.37 
 
 
303 aa  60.1  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  38.89 
 
 
289 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  29.31 
 
 
298 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  39.29 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  29.59 
 
 
296 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  38.46 
 
 
296 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.28 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  27.33 
 
 
309 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  35.58 
 
 
301 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  30.07 
 
 
301 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  35.96 
 
 
301 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  35.42 
 
 
349 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  34.57 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  26.38 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>