65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3331 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  100 
 
 		 303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  36.63 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  36.03 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  38.75 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  38.41 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  38.41 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  38.41 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  34.93 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  34.93 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  34.31 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  34.85 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  36.07 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  35.12 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  37.41 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  34.25 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  34.63 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  34.25 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  32.13 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  33.98 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  34.64 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  35.99 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  31.68 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  34.95 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  31.68 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  34.95 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  31 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  32.13 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  28.57 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  32.45 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  32.14 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  32.8 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  35.09 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  32.5 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  32.5 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  31.79 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  31.79 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  32.2 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  34.65 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  32.78 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  32.78 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  31.09 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  30.59 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  31.31 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  31.45 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  32.6 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  30.65 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  30.04 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  27.17 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  25.84 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  28.57 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  25.44 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  25.46 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  31.42 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  31.42 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.99 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  27.65 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  31.44 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  35.11 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  28.99 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  28.99 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  28.4 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  23.2 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  31.06 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  27.23 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  26.96 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>