52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0685 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  31.83 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  31.73 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  30.65 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  32.15 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  30.32 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  33.45 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  29.03 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  29.35 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  29.17 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  29.03 
 
 		 302 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  29.03 
 
 		 302 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  28.8 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  29.26 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  30.39 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  29.22 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  31.11 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  29.9 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  29.13 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  27.12 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  27.88 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  28.98 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  28.12 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  28.81 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  28.81 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  27.04 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  28.8 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  27.05 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  27.97 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  26.92 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  28.53 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  26.2 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  27.01 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  27.01 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  26.69 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  26.69 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  26.3 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  28.27 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  26.63 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  25.16 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  28.21 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  27.13 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  26.38 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  26.03 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  28.87 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  26.97 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  25.81 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  25.32 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  25.79 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  24.07 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  25.32 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>