70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3189 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  76.82 
 
 		 302 aa  474  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  76.16 
 
 		 302 aa  474  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  76.49 
 
 		 302 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  75.83 
 
 		 302 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  73.51 
 
 		 302 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  74.5 
 
 		 302 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  73.84 
 
 		 302 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  68.67 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  65.89 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  61.92 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  61.92 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  61.59 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  61.92 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  60.93 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  60.93 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  61.59 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  61.2 
 
 		 303 aa  359  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  59.27 
 
 		 295 aa  331  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  58.61 
 
 		 295 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  57.86 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  55.3 
 
 		 298 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  49.67 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  49.33 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  48.81 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  48.84 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  47.81 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  46.62 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  47.18 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  47.67 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  45.25 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  45.25 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  40.19 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  45.48 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  43.56 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  43.56 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  40.13 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  43.84 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  38.65 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  43.14 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  41.72 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  39.8 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  35.64 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  35.19 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  35.38 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  39.18 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  39.18 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  33.68 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  34.5 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  31.06 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  30.63 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  33.75 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  28.98 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.72 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  36.81 
 
 		 367 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  36.26 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  27.68 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  31.73 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  34.24 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  36.06 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  34.24 
 
 		 371 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  34.24 
 
 		 371 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  42.16 
 
 		 114 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  42.16 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  29.88 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  30.06 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  33.95 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  37.76 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  28.4 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  28.07 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>