62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0587 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  79.38 
 
 
331 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  35.25 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  37.94 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  36.23 
 
 
302 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  35.85 
 
 
295 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  36.19 
 
 
302 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  33.99 
 
 
296 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  37.4 
 
 
296 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  35.02 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  35.07 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  33.2 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  33.96 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  35.94 
 
 
299 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  33.59 
 
 
302 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  32.64 
 
 
349 aa  95.9  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  33.08 
 
 
301 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  32.71 
 
 
302 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  33.86 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  32.33 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  32.33 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  32.33 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  33.08 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  32.71 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  33.07 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  33.22 
 
 
349 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  32.95 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  34.09 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  32.34 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  34.98 
 
 
302 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  32.34 
 
 
302 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  31.85 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  33.47 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  31.62 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  32.94 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  32.94 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  31.13 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  31.13 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  35.79 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  30.74 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  31.8 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  32.38 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  28.7 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  29.17 
 
 
309 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  31.64 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  33.82 
 
 
367 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  30.28 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  30.28 
 
 
371 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  31.11 
 
 
371 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  31.39 
 
 
367 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  27.08 
 
 
290 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  26.26 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  33.1 
 
 
377 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  28.47 
 
 
326 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  28.35 
 
 
312 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  32.58 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  32.58 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  32.91 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.31 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  25.6 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  28.06 
 
 
372 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  26.32 
 
 
374 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>