69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1621 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  100 
 
 
289 aa  570  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  46.71 
 
 
299 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  44.98 
 
 
297 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  44.98 
 
 
297 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  44.33 
 
 
295 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  44.64 
 
 
297 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  44.64 
 
 
297 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  43.99 
 
 
298 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  43.84 
 
 
302 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  41.78 
 
 
296 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  44.44 
 
 
302 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  44.44 
 
 
302 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  41.9 
 
 
295 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  41.81 
 
 
302 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  43.15 
 
 
302 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  43.6 
 
 
303 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  41.95 
 
 
302 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  42.14 
 
 
302 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  42.14 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  45.3 
 
 
303 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  43.1 
 
 
295 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  41.81 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  41.81 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  39.13 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  39.46 
 
 
302 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  42.33 
 
 
302 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  39.73 
 
 
302 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  42.18 
 
 
305 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  39.39 
 
 
302 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  41.3 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  38.7 
 
 
298 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  41.64 
 
 
301 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  37.29 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  39.53 
 
 
302 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  39.51 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  39.59 
 
 
301 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  40.21 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  40.4 
 
 
298 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  34.01 
 
 
296 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  35.44 
 
 
269 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  39.1 
 
 
298 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  34.25 
 
 
279 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  34.86 
 
 
263 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  32.3 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  33.54 
 
 
326 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  33.61 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  33.64 
 
 
331 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  30.06 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  32 
 
 
349 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  37.22 
 
 
367 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  30.04 
 
 
349 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  33.71 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  33.71 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  35.56 
 
 
367 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  28.79 
 
 
337 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  33.59 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  27.99 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  27.9 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  30.77 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  30.22 
 
 
371 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  30.22 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  42.86 
 
 
114 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  42.86 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  38.89 
 
 
388 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  27.78 
 
 
369 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  25.87 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  33 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  35.64 
 
 
377 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  29.91 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>