46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01990 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  35.44 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  30.03 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  30.89 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  28.31 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  27.68 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  28.66 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  27.88 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  29.64 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  27.52 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  29.07 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  27.68 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  28.83 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  28.83 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  28.83 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  28.83 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  27.05 
 
 		 295 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  28.44 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  27.89 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  28.12 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  27.27 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  26.17 
 
 		 295 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  25.84 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  26.91 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  26.52 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  26.84 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  27.84 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  25.15 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  27.3 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  25.45 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  25.53 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  25.15 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  28.79 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  26.14 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  25.15 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  26.62 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  24.55 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  25.91 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  25.91 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  26.67 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  26.67 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  30.52 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  30 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  23.42 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  22.16 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  27.52 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>