66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2900 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  100 
 
 
309 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  44.48 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  45.13 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  43.38 
 
 
299 aa  241  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  42.36 
 
 
303 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  41.8 
 
 
302 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  40.19 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  41.8 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  40.19 
 
 
302 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  39.23 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  39.23 
 
 
302 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  40.53 
 
 
295 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  40.84 
 
 
302 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  40.51 
 
 
302 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  40.51 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  40.32 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  40.51 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  39.87 
 
 
302 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  39.49 
 
 
303 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  39.35 
 
 
302 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  39.87 
 
 
302 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  40 
 
 
301 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  42.68 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  39.03 
 
 
302 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  38.91 
 
 
301 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  37.34 
 
 
302 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  36.98 
 
 
301 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  39.02 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  40.32 
 
 
298 aa  195  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  39.41 
 
 
298 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  38.44 
 
 
296 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  37.13 
 
 
293 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  35.71 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  37.29 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  35.71 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  35.39 
 
 
297 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  35.39 
 
 
297 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  33.88 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  32.58 
 
 
298 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  29.66 
 
 
326 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  31.76 
 
 
269 aa  142  9e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  34.55 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  30.7 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  30.82 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  28.91 
 
 
303 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  33 
 
 
279 aa  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  25.15 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  27.3 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  30.3 
 
 
371 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  29.8 
 
 
371 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  29.8 
 
 
371 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  26.9 
 
 
349 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  26.02 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  28.1 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  35.05 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  28.1 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  26.81 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  35.38 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  37.74 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  28.91 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  36.79 
 
 
108 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  26.43 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  25.16 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  29.67 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  28.49 
 
 
388 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  27.92 
 
 
377 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>