71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3820 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  100 
 
 
298 aa  592  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  55.96 
 
 
302 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  56.95 
 
 
302 aa  343  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  57.53 
 
 
303 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  57.62 
 
 
302 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  56.62 
 
 
302 aa  342  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  56.62 
 
 
302 aa  342  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  56.29 
 
 
302 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  55.3 
 
 
302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  55.96 
 
 
302 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  57.57 
 
 
302 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  54.64 
 
 
302 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  55.3 
 
 
302 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  54.64 
 
 
302 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  55.3 
 
 
302 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  55.3 
 
 
302 aa  329  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  54.97 
 
 
302 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  55.52 
 
 
303 aa  311  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  54.3 
 
 
302 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  52.84 
 
 
295 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  50.5 
 
 
295 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  50.84 
 
 
305 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  44.52 
 
 
298 aa  238  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  49 
 
 
293 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  43.54 
 
 
301 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  43.54 
 
 
301 aa  225  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  45.79 
 
 
296 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  42.12 
 
 
295 aa  215  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  41.5 
 
 
301 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  46.15 
 
 
293 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  40.86 
 
 
299 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  40.53 
 
 
297 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  40.53 
 
 
297 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  40.32 
 
 
309 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  40.2 
 
 
297 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  40.2 
 
 
297 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  35.79 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  38.8 
 
 
298 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  36.81 
 
 
326 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  39.73 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  37.54 
 
 
279 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  33.74 
 
 
326 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  38.89 
 
 
298 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  34.63 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  33.1 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  31.39 
 
 
303 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  36.23 
 
 
285 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  36.23 
 
 
285 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  32.01 
 
 
290 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  31.42 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  35.52 
 
 
367 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  36.11 
 
 
367 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  31.91 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  27.71 
 
 
349 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  28.12 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  29.21 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  27.12 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  32.93 
 
 
369 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  26.14 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  31.52 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  31.52 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  31.52 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  31.28 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  31.78 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  43.33 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  37.62 
 
 
114 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  37.62 
 
 
108 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  34.57 
 
 
377 aa  55.8  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  25.14 
 
 
372 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  29.29 
 
 
387 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  26.7 
 
 
360 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>