72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2887 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  94.01 
 
 		 367 aa  705    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  100 
 
 		 367 aa  743    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  57.95 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  57.41 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  57.68 
 
 		 371 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  47.99 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  35.51 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  35.5 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  32.34 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  41.53 
 
 		 295 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  37.16 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  37.16 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  36.61 
 
 		 297 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  36.61 
 
 		 297 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  40.66 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  34.74 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  36.81 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  39.67 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  38.8 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  40.78 
 
 		 302 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  38.71 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  39.01 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  40.22 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  39.01 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  39.01 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  39.01 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  38.46 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  35.68 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  37.36 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  36.81 
 
 		 302 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  37.91 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  40.44 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  36.26 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  39.67 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  37.91 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  36.81 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  37.36 
 
 		 303 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  34.41 
 
 		 295 aa  92.8  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  32.97 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  33.49 
 
 		 301 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  23.66 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  30.68 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  35.75 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  33.7 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  35.48 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  31.16 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  35.56 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  28.57 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  34.54 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  30.05 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  29.77 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  33.88 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  36.31 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  31.31 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  30.3 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  29.65 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  32.96 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  30.05 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  27.36 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  26.85 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  30.77 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  33.82 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  29.77 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2511  hypothetical protein  32.1 
 
 		 106 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  29.03 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  29.94 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  29.94 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  29.03 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  34.26 
 
 		 114 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  28.39 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  32.71 
 
 		 108 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  27.54 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>