57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3652 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  100 
 
 		 389 aa  780    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  51.91 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  51.05 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  30.36 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  33.93 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  34.38 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  30.86 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  30.86 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  31.62 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  28.21 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  27.95 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  30.14 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  36.89 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  29.41 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  33.67 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  31.42 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  27.48 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  27.48 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  31.47 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  27.48 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  32.19 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  26.17 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  28.4 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  32.87 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  32.7 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  32.68 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  31.71 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  28.68 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  30.21 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  30.96 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  30.68 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  30.68 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  26.93 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  26.85 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  28 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  25.94 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  32.2 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  28.38 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  28.28 
 
 		 359 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  30.6 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  28.28 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  25.44 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  29.86 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  28.9 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  28.28 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  27.61 
 
 		 359 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  29.9 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  26.52 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  30.41 
 
 		 299 aa  46.2  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2950  baseplate J family protein  28.06 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  31.31 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  29.02 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  28.65 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  28.28 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2820  hypothetical protein  25.48 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  31.11 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  24.5 
 
 		 352 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>