26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0255 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  100 
 
 
396 aa  813    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  57.79 
 
 
403 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  56.82 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  43.75 
 
 
390 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  43.75 
 
 
390 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  44.85 
 
 
394 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  43.19 
 
 
394 aa  316  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  43.3 
 
 
394 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  41.97 
 
 
394 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  42.78 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  41.97 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  41.71 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  42.27 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  42.01 
 
 
400 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  41.46 
 
 
395 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  39.53 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  37.76 
 
 
387 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  54.11 
 
 
193 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  31.62 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  37.05 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  31.56 
 
 
387 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  30.26 
 
 
605 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  32.72 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  27.78 
 
 
689 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4278  Baseplate J family protein  27.8 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178456  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  30.37 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>