27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05042 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  816    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  49.87 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  48.33 
 
 
400 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  44.68 
 
 
390 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  44.68 
 
 
390 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  44.7 
 
 
394 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  44.44 
 
 
394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  44.44 
 
 
394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  42.35 
 
 
394 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  40.35 
 
 
402 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  40.45 
 
 
403 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  42.57 
 
 
394 aa  325  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  41.31 
 
 
394 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  39.32 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  37.91 
 
 
387 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  38.13 
 
 
399 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  41.46 
 
 
396 aa  269  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  33.93 
 
 
389 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30 
 
 
390 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  39.53 
 
 
193 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  33.82 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  27.71 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  27.23 
 
 
374 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  26.79 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  26.26 
 
 
605 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  26.32 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  28.26 
 
 
360 aa  42.7  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>