27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1947 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  100 
 
 		 360 aa  715    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  74.72 
 
 		 360 aa  552  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  29.36 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30.17 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  29.96 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  29.39 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  29.55 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  27.03 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  28.12 
 
 		 689 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  26.69 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  32.72 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  29.84 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  25.8 
 
 		 372 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  32.39 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  29.61 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  28.57 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  28.24 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  33.51 
 
 		 353 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  24.75 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  29.1 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  26.28 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  26.82 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  28.33 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  26.77 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  28.42 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  23.99 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  27.78 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>