31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3860 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  100 
 
 		 347 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  47.84 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  43.55 
 
 		 347 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  40.51 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  34.66 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  33.33 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  33.33 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  33.33 
 
 		 359 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  31.87 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  33.7 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  33.7 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  33.52 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  29.66 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  29.66 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  29.66 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  31.85 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  27.99 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  29.06 
 
 		 378 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  30.68 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  30.12 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  28.5 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  28.45 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  30.5 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  28.42 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  32.25 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  29.19 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  25.27 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  28.89 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2492  baseplate J-like protein  31.93 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  27.94 
 
 		 676 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1008 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>