28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2494 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  71.37 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  60.16 
 
 		 359 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  60.16 
 
 		 359 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  59.76 
 
 		 359 aa  298  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  41.43 
 
 		 346 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  38.67 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  37.35 
 
 		 351 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  31.85 
 
 		 347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  34.83 
 
 		 370 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  33.33 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  33.81 
 
 		 378 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  31.52 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  32.98 
 
 		 382 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  30.55 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  30.91 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  30.91 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  30.59 
 
 		 355 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  30.59 
 
 		 355 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  30.15 
 
 		 372 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  32.51 
 
 		 386 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  28.78 
 
 		 363 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  29.41 
 
 		 355 aa  85.5  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  33.19 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  27.35 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  33.16 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  29.79 
 
 		 376 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1446  phage Mu protein gp47-like protein  22.92 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>