31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2084 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  100 
 
 		 382 aa  775    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  57.74 
 
 		 378 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  58.01 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  58.01 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  57.22 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  42.93 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  43.22 
 
 		 386 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  33.24 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  31.89 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  30.47 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  31.61 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  30.1 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  30.1 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  30.1 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  29.46 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  31.59 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  28.83 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  26.05 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  32.98 
 
 		 249 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  27.66 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  28.83 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  28.83 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  27.47 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  29.17 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  29.72 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1449  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  27.61 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  40 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  28.91 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  25.38 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  24.88 
 
 		 676 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>