48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3733 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  100 
 
 		 351 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  44.44 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  44.19 
 
 		 347 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  40.51 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  39.43 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1044  baseplate assembly protein J  37.19 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  38.29 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  38.29 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  38.29 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1870  baseplate J family protein  35.6 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000510661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  33.77 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  33.77 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3113  baseplate J family protein  35.86 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  33.51 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3047  putative bacteriophage tail protein GP47,Mu-like  36.62 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.965464  hitchhiker  0.000022489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4482  baseplate J family protein  40.79 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.990978  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6583  putative bacteriophage protein  33.15 
 
 		 372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  33.43 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  33.43 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2702  hypothetical protein  34.16 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2494  Baseplate J family protein  37.35 
 
 		 249 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0958877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2444  Baseplate J family protein  38.85 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.950209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2084  putative baseplate J protein  30.89 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.733607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  30.9 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  31.47 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0749  Baseplate J family protein  35.29 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  32.5 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4250  Baseplate J family protein  27.85 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  29.62 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  30.08 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  26.49 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  30.33 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1421  Baseplate J family protein  28.63 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  30.66 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  26.21 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  28.85 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  27.07 
 
 		 689 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  27.43 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  29.31 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  26.32 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  29.79 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  31.09 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  31.09 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  25.38 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0793  putative phage tail protein  28.22 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  29.38 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  29.38 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  29.38 
 
 		 394 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>