56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3391 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  100 
 
 
387 aa  776    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  51.82 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3652  Baseplate J family protein  51.08 
 
 
389 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  31.67 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  31.38 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0255  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  30.31 
 
 
396 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  33.61 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  33.61 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0738  putative bacteriophage protein  34.17 
 
 
400 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05042  hypothetical protein  33.82 
 
 
395 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0932  putative bacteriophage protein  29.6 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.374954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1300  putative bacteriophage protein  32.65 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1043  hypothetical protein, putative phage gene  28.9 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  34.5 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  30.09 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  30.09 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  30.09 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  32 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2584  baseplate J family protein  26.17 
 
 
352 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  28.02 
 
 
360 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1039  hypothetical protein  30.61 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0572  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  28.64 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.415024  normal  0.27135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  26.91 
 
 
689 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2251  tail protein  28.27 
 
 
359 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2248  tail protein  28 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4481  tail protein  28 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720174 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  32.16 
 
 
302 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  28.28 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  28.28 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  31.36 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  29.59 
 
 
302 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  27.78 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  27.78 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  27.41 
 
 
302 aa  53.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  27.78 
 
 
302 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  29.51 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  30.77 
 
 
302 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  28.25 
 
 
302 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0714  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  28.8 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  29.27 
 
 
302 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1162  baseplate J-like protein  26.13 
 
 
347 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4812  Baseplate J family protein  27.69 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0564  Baseplate J family protein  26.14 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.194278  hitchhiker  0.000000000000890546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  24.92 
 
 
374 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  27.64 
 
 
410 aa  46.6  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3733  baseplate J-like protein  30.96 
 
 
351 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0696  hypothetical protein  29.28 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0741  hypothetical protein  29.28 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  28.37 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  34.38 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1489  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372871  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  28.41 
 
 
303 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3860  phage FluMu protein gp47  26.02 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  27.06 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0185  baseplate J family protein  26.87 
 
 
353 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4587  baseplate J-like protein  28.41 
 
 
346 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>