70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0867 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  76.16 
 
 
302 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  73.84 
 
 
302 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  73.51 
 
 
302 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  71.52 
 
 
302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  71.52 
 
 
302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  71.85 
 
 
302 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  72.85 
 
 
302 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  69.9 
 
 
303 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  70.86 
 
 
302 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  65.56 
 
 
302 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  65.56 
 
 
302 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  65.56 
 
 
302 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  64.9 
 
 
302 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  64.57 
 
 
302 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  64.57 
 
 
302 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  61.54 
 
 
303 aa  363  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  56.95 
 
 
302 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  57.43 
 
 
295 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  58.8 
 
 
295 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  57.86 
 
 
305 aa  328  7e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  55.3 
 
 
298 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  51.7 
 
 
295 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  47.37 
 
 
298 aa  269  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  45.85 
 
 
299 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  47.65 
 
 
301 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  47.3 
 
 
301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  45.64 
 
 
301 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  48 
 
 
293 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  46.69 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  44.55 
 
 
297 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  44.55 
 
 
297 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  44.55 
 
 
297 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  44.55 
 
 
297 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  40.32 
 
 
309 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  43.19 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  41.67 
 
 
298 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  39.47 
 
 
296 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  37.42 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  38.04 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  39.2 
 
 
279 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  39.46 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  36.84 
 
 
298 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  34.78 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  34.51 
 
 
263 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  35.87 
 
 
285 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  33.58 
 
 
303 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  35.87 
 
 
285 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  34.46 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  30.1 
 
 
290 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  29.71 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  30.67 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.09 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  28.53 
 
 
331 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  27.88 
 
 
337 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  36.26 
 
 
367 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  35.16 
 
 
367 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  29.26 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  26.89 
 
 
388 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  33.33 
 
 
369 aa  89.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  35.07 
 
 
263 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  31.52 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  31.52 
 
 
371 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  30.98 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  29.19 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  28.31 
 
 
372 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  34.31 
 
 
114 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  34.31 
 
 
108 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  31.06 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  27.06 
 
 
387 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>