71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4957 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  100 
 
 		 372 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  47.98 
 
 		 374 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  36.44 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  35.98 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  31.72 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  31.45 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  32.34 
 
 		 367 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  31.72 
 
 		 371 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  32.07 
 
 		 367 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  30.69 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  30.69 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  27.24 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  30.24 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  29.26 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  29.26 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  29.73 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  30.25 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  44.83 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  29.63 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  36.97 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  29.01 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  26.83 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  28.31 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  28.09 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  26.06 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  27.8 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  27.37 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  29.01 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  29.9 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  25.45 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  25.68 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  27.17 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  27.27 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  28.4 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  30.36 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  30.86 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  27.34 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2511  hypothetical protein  37.8 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  25.14 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  25.14 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  25.14 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  26.67 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  30.06 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  30.23 
 
 		 298 aa  57  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  28.74 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  31.3 
 
 		 263 aa  55.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5069  hypothetical protein  25.44 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.418785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0687  hypothetical protein  25.44 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  27.88 
 
 		 303 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  30.1 
 
 		 296 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0912  putative phage gene  23.57 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2920  phage protein  23.05 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0981084  hitchhiker  0.00000000000183456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2785  phage protein  23.05 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  32 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3476  phage protein  23.05 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  28.28 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  33 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  24.59 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  27.64 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  25.41 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2524  baseplate J family protein  32.67 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1947  Baseplate J family protein  29.19 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  27.27 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  27.27 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  31.54 
 
 		 410 aa  46.6  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  26.96 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2811  baseplate J family protein  28.35 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1473  baseplate J-like protein  28.35 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.700179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2733  baseplate J-like protein  28.35 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2820  hypothetical protein  29.59 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  27.38 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>