70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2763 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  99.01 
 
 
302 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  99.01 
 
 
302 aa  597  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  98.34 
 
 
302 aa  594  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  90.07 
 
 
302 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  89.74 
 
 
302 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  68.54 
 
 
302 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  66.23 
 
 
302 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  66.56 
 
 
302 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  65.56 
 
 
302 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  66.23 
 
 
302 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  64.9 
 
 
302 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  67.11 
 
 
303 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  65.23 
 
 
302 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  61.59 
 
 
302 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  61.92 
 
 
302 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  62.21 
 
 
303 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  61.26 
 
 
302 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  61 
 
 
295 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  59.67 
 
 
295 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  58.19 
 
 
305 aa  324  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  56.95 
 
 
298 aa  322  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  49.5 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  50 
 
 
301 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  47.84 
 
 
299 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  46.46 
 
 
301 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  48.83 
 
 
296 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  47.78 
 
 
295 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  46.46 
 
 
301 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  47.67 
 
 
293 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  50.17 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  44.55 
 
 
297 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  44.55 
 
 
297 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  44.88 
 
 
297 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  44.88 
 
 
297 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  40.84 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  41.46 
 
 
326 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  38.64 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  39.33 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  40 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  42.14 
 
 
289 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  38.54 
 
 
279 aa  169  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  40.14 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  39.05 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  34.42 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  33.21 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  36.47 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  36.47 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  31.19 
 
 
349 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  32.36 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  30.63 
 
 
331 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  31.21 
 
 
349 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  31.72 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  39.01 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  37.91 
 
 
367 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  33.75 
 
 
331 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01990  hypothetical protein  28.83 
 
 
337 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0685  Baseplate J family protein  29.03 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  33.16 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  32.09 
 
 
371 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  32.09 
 
 
371 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  32.71 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  28.95 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  35.48 
 
 
377 aa  82.4  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  29.26 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  34.95 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  34.95 
 
 
114 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  38.05 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  25.14 
 
 
372 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3391  baseplate assembly protein, putative  27.78 
 
 
387 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>