62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1220 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  100 
 
 		 374 aa  761    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  47.98 
 
 		 372 aa  355  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  40.73 
 
 		 369 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  35.5 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  34.15 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  32.26 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  32.26 
 
 		 371 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  32.26 
 
 		 371 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  32 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  33.86 
 
 		 297 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  33.86 
 
 		 297 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  33.33 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  33.33 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  33.51 
 
 		 302 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  29.36 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  31.89 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  30.32 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  32.45 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  33.54 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  31.35 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  29.79 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  29.26 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  30.32 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  29.26 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  32.56 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  29.26 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  33.16 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  29.26 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  28.76 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  30.06 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  29.19 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  31.11 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  29.19 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  28.49 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  29.19 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  30.72 
 
 		 302 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  28.65 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2511  hypothetical protein  34.44 
 
 		 106 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  27.04 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  31.44 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  29.41 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  25.38 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  33.33 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  31.28 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  29.02 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  30.64 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  31.13 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  27.46 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  26.97 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1929  Baseplate J family protein  26.79 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  31.07 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  26.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  25.54 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  30.47 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  30.48 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  34.78 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  29.91 
 
 		 289 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  29.22 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  28.57 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2200  hypothetical protein  31.06 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  25.47 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  25.79 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>