17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2200 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2200  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243728  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1176  putative bacteriophage protein  29.78 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118784  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0817  putative bacteriophage protein  29.88 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2410  putative bacteriophage protein  32.93 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1803  putative bacteriophage protein  30.29 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3651  putative bacteriophage protein  29.49 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0414851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1015  hypothetical protein  26.42 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.573023  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1252  hypothetical protein  26.42 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1285  hypothetical protein  26.42 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1242  hypothetical protein  27.89 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2933  hypothetical protein  27.37 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2245  putative bacteriophage protein  32.14 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.466176 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0855  hypothetical protein  26.52 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.253257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1784  hypothetical protein  28.64 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2820  hypothetical protein  24.58 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  31.06 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1546  hypothetical protein  21.9 
 
 		 605 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>