64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2327 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  100 
 
 		 285 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  40.91 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  36.84 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  31.1 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  30.9 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  30.67 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  31.72 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  31.72 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  31.72 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  31.72 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  28.47 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  30.43 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  31.72 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  31.72 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  29.51 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  31.44 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  30.41 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  29.79 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  30.41 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  31.67 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  28.09 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  30.07 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  32.48 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  29.51 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  31.83 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  28.72 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  30.69 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  31.7 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  30.1 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  31.08 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  28.79 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  30.77 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  27.21 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  27.21 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  30.77 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  30.87 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  30.87 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  28.09 
 
 		 303 aa  99  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  29.09 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  30.29 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  26.96 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  27.36 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  27.68 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  26.87 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  29.67 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  27.99 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  26.74 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  25.96 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  26.33 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  24.04 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  31.37 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  28.92 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  28.42 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  30.05 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  28.28 
 
 		 388 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  26.97 
 
 		 374 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  24.7 
 
 		 349 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  31.1 
 
 		 377 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  24.59 
 
 		 372 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  28.05 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  27.87 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1141  baseplate J-like protein  23.66 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>