59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2635 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2635  baseplate J family protein  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0882929  hitchhiker  0.000285903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2601  baseplate J family protein  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724499  hitchhiker  0.0000000000333065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  39.18 
 
 
302 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  39.47 
 
 
302 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  38.72 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  39.03 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  30.15 
 
 
269 aa  138  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  39.54 
 
 
295 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  36.47 
 
 
302 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  34.43 
 
 
279 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  32.23 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  36.09 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  36.09 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  37.46 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  36.09 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  36.04 
 
 
302 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  39.47 
 
 
295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  35.87 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  36.67 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  36.47 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  38.27 
 
 
303 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  35.48 
 
 
302 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  36.06 
 
 
302 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  37.59 
 
 
295 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  37.45 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  33.83 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  33.46 
 
 
302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  36.29 
 
 
296 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  38.2 
 
 
305 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  35.91 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  36.23 
 
 
298 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  33.67 
 
 
301 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  32.88 
 
 
326 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  36.57 
 
 
293 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  29.49 
 
 
301 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  34.59 
 
 
326 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  31.31 
 
 
301 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  27.21 
 
 
285 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  32.57 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  32.57 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  32.57 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  33.21 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  31.8 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  31.8 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  33.71 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  33.57 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  26.81 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  34.59 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  33.63 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  31.74 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  39.36 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  32.55 
 
 
331 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  26.13 
 
 
349 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  30.77 
 
 
377 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  26.98 
 
 
349 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  23.38 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  27.27 
 
 
372 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  32.58 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  29.94 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>