71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4539 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4539  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4538  hypothetical protein  99.19 
 
 		 371 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.15986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  99.19 
 
 		 371 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2887  Baseplate J family protein  57.95 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.551416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1575  Baseplate J family protein  56.87 
 
 		 367 aa  414  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2907  prophage MuMc02, bacteriocin protein, putative  49.07 
 
 		 377 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0932  Baseplate J family protein  34.92 
 
 		 369 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1220  baseplate J family protein  32.26 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4957  baseplate J family protein  31.72 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.466467  normal  0.870865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01350  phage-related baseplate assembly protein  34.22 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0891  Baseplate J family protein  34.24 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0400  phage-related baseplate assembly protein  32.62 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1139  phage-related baseplate assembly protein  32.62 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.442628  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1291  baseplate J-like protein  36.02 
 
 		 299 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.482506 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1161  baseplate J family protein  32.62 
 
 		 297 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0358  baseplate J family protein  32.62 
 
 		 297 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1825  Baseplate J family protein  35.29 
 
 		 302 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1335  baseplate J-like protein  35.26 
 
 		 301 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3486  baseplate J family protein  34.39 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3035  baseplate assembly protein J  33.16 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  decreased coverage  0.000161965 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3189  Baseplate J family protein  34.24 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3037  baseplate assembly protein GpJ  34.95 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000746208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2852  baseplate assembly protein J  32.62 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4379  baseplate assembly protein J  34.95 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.00000851022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4339  baseplate assembly protein GpJ  34.95 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0312894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08030  putative phage baseplate assembly protein  33.16 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117482  hitchhiker  0.00024186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3302  baseplate J family protein  32.61 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00849  hypothetical protein  32.09 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00843  phage baseplate assembly protein  32.09 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0938  baseplate assembly protein J  32.09 
 
 		 302 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2763  baseplate J family protein  32.09 
 
 		 302 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4851  baseplate J family protein  33.68 
 
 		 301 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37460  Phage P2 baseplate assembly gpJ-like protein  36.08 
 
 		 305 aa  86.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0762  hypothetical protein  32.07 
 
 		 295 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0192  baseplate J family protein  33.16 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.566904 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2092  Baseplate J family protein  32.09 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1386  baseplate J-like protein  33.69 
 
 		 303 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0867  baseplate J family protein  31.52 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0687831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2343  baseplate J family protein  33.86 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0233  baseplate assembly protein J, putative  23.36 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1923  baseplate assembly-like protein  32.09 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2900  baseplate J family protein  29.8 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.687314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2654  Baseplate J family protein  31.52 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3820  Baseplate J family protein  30.89 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4044  baseplate J family protein  30.82 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0332187  hitchhiker  0.00000000000107571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3054  pyocin R2_PP, baseplate/tail fiber protein  29.36 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.186088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2216  baseplate assembly protein J  28.8 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0689  baseplate J-like protein  25.68 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0283  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein J, putative  28.31 
 
 		 269 aa  62.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1621  baseplate J-like protein  30.22 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.45681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3400  baseplate assembly protein J  28.73 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1864  baseplate J family protein  29.65 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3653  phage baseplate assembly protein  35.51 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0265465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3331  baseplate J-like protein  30 
 
 		 303 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3669  bacteriophage baseplate assembly protein J  34.58 
 
 		 108 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1207  baseplate J family protein  28.77 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4135  baseplate J family protein  31.72 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_002978  WD0639  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein J, putative  27.32 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.170829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1453  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  25.93 
 
 		 403 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2750  uncharacterized phage Mu protein GP47-like protein  25.28 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.619442  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  28.65 
 
 		 796 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2299  baseplate J family protein  28.4 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.362449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2382  baseplate J-like protein  27.91 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.076161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1498  baseplate J family protein  29.38 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0740  GPJ of phage P2-like  28.14 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1303  baseplate assembly protein, putative  25.57 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000335717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0587  Baseplate J family protein  31.11 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2327  Phage-related baseplate assembly protein  28.57 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  29.05 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  25.7 
 
 		 650 aa  43.5  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  29.05 
 
 		 469 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>