55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1417 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  100 
 
 
650 aa  1290    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  55.21 
 
 
649 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  57.1 
 
 
653 aa  687    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  44.19 
 
 
656 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  46.17 
 
 
644 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  43.75 
 
 
647 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  42.11 
 
 
706 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  43.93 
 
 
647 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  41.8 
 
 
676 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  40.55 
 
 
652 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  43.75 
 
 
650 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  41.08 
 
 
676 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  35.9 
 
 
737 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  32.83 
 
 
785 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  30.28 
 
 
692 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  31.99 
 
 
651 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  30.2 
 
 
677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  33.87 
 
 
1008 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  29.55 
 
 
649 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  30.48 
 
 
1203 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  29.6 
 
 
1101 aa  151  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  34.21 
 
 
796 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  27.89 
 
 
1119 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  27.24 
 
 
1080 aa  125  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  34.95 
 
 
854 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  46.36 
 
 
843 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  56.76 
 
 
289 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  43.24 
 
 
760 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  29.94 
 
 
730 aa  84  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  31.22 
 
 
469 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  27.81 
 
 
469 aa  81.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  27.96 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  30.61 
 
 
833 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  30.56 
 
 
1744 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  26.53 
 
 
833 aa  74.7  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  33.11 
 
 
1183 aa  74.3  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  35.82 
 
 
1168 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  22.52 
 
 
1332 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  34.76 
 
 
503 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  33.66 
 
 
503 aa  64.3  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  33.33 
 
 
814 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  30.99 
 
 
957 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  27.22 
 
 
1258 aa  62  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  22.39 
 
 
1236 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  23.04 
 
 
1124 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  22.49 
 
 
1022 aa  55.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  28.05 
 
 
1007 aa  54.7  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  22.39 
 
 
1235 aa  53.9  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  26.25 
 
 
1088 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  24.83 
 
 
1413 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  37.5 
 
 
986 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  30.85 
 
 
1246 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  27.59 
 
 
1358 aa  47.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  21.81 
 
 
1252 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4454  hypothetical protein  26.26 
 
 
371 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>