34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1678 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1252 aa  909    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  100 
 
 		 1235 aa  2530    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  90.13 
 
 		 1236 aa  2247    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  34 
 
 		 1007 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1124 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1258 aa  393  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1246 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1022 aa  304  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1289 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1332 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1413 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1358 aa  196  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1286 aa  138  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1203 aa  68.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1119 aa  66.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  31.82 
 
 		 760 aa  66.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  27.67 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1101 aa  60.1  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  27.95 
 
 		 656 aa  58.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  28.37 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  27.75 
 
 		 647 aa  57.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1080 aa  55.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  22.39 
 
 		 650 aa  53.5  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  25.88 
 
 		 676 aa  51.6  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1008 aa  51.6  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  27.07 
 
 		 676 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  25.74 
 
 		 653 aa  50.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  22.77 
 
 		 649 aa  49.3  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  25.99 
 
 		 730 aa  49.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  22.58 
 
 		 785 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  26.53 
 
 		 677 aa  48.9  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  26.56 
 
 		 652 aa  48.5  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  24.23 
 
 		 649 aa  44.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  26.36 
 
 		 737 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>