32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5247 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  100 
 
 		 1332 aa  2750    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1252 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1236 aa  326  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1022 aa  290  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1235 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1124 aa  258  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  30.26 
 
 		 1007 aa  227  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  32.3 
 
 		 1258 aa  226  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1289 aa  215  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1358 aa  199  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1246 aa  192  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1413 aa  190  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  25 
 
 		 1286 aa  154  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  27.92 
 
 		 649 aa  77.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1119 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1101 aa  68.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  22.52 
 
 		 650 aa  67  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1080 aa  63.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  24.8 
 
 		 760 aa  62.4  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  25 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  23 
 
 		 653 aa  57  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1008 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1203 aa  54.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  25.38 
 
 		 656 aa  53.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  25.31 
 
 		 647 aa  53.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  20.91 
 
 		 469 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  20.91 
 
 		 469 aa  49.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  26.09 
 
 		 706 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  22.26 
 
 		 676 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  24.66 
 
 		 650 aa  46.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  20.75 
 
 		 692 aa  46.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  20.21 
 
 		 469 aa  45.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>