52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  100 
 
 		 649 aa  1283    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  55.21 
 
 		 650 aa  684    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  60.4 
 
 		 653 aa  755    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  44.55 
 
 		 644 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  41.4 
 
 		 656 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  44.22 
 
 		 647 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  41.59 
 
 		 676 aa  458  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  42.88 
 
 		 650 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  41.72 
 
 		 647 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  40.77 
 
 		 676 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  40.27 
 
 		 652 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  34.94 
 
 		 737 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  32.43 
 
 		 785 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  43.12 
 
 		 706 aa  250  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  32.15 
 
 		 651 aa  223  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  29.73 
 
 		 692 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  32.81 
 
 		 677 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1008 aa  197  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1203 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  28.61 
 
 		 649 aa  188  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  28.17 
 
 		 730 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1080 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1119 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1101 aa  134  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  34.86 
 
 		 854 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  47.54 
 
 		 796 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  45.16 
 
 		 843 aa  114  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  29.75 
 
 		 760 aa  97.8  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  52.7 
 
 		 289 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1332 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  28.06 
 
 		 469 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  27.51 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1183 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  26.45 
 
 		 469 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  31.22 
 
 		 1744 aa  64.3  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  30.52 
 
 		 986 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1022 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1088 aa  61.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 833 aa  61.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  27.34 
 
 		 833 aa  60.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  34.16 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  29.74 
 
 		 957 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1258 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  34.19 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  27.35 
 
 		 814 aa  55.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0673  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1358 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1413 aa  50.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1235 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1236 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1168 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3606  50S ribosomal protein L13E  24.52 
 
 		 1007 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975656  hitchhiker  0.0000178294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1124 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>