55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1865 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  100 
 
 
1080 aa  2188    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  28.89 
 
 
1203 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  28.82 
 
 
1008 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  26.03 
 
 
1101 aa  310  9e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  30.35 
 
 
1119 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  29.96 
 
 
651 aa  163  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  28.36 
 
 
706 aa  161  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  28.98 
 
 
676 aa  153  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  27.5 
 
 
649 aa  152  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  27.88 
 
 
676 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  29.45 
 
 
650 aa  145  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  28.81 
 
 
647 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  28.12 
 
 
737 aa  141  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  28.1 
 
 
644 aa  141  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  33.96 
 
 
760 aa  132  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  26.56 
 
 
656 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  30.93 
 
 
692 aa  127  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  25.27 
 
 
652 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  25.04 
 
 
647 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  27.79 
 
 
677 aa  121  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  31.09 
 
 
730 aa  117  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  25.4 
 
 
649 aa  114  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  26.4 
 
 
653 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4352  hypothetical protein  26.44 
 
 
796 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0800102  normal  0.244923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  29.72 
 
 
650 aa  104  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  27.7 
 
 
833 aa  92.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  29.67 
 
 
469 aa  89  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  28.72 
 
 
854 aa  87.8  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  28.48 
 
 
1088 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  29.67 
 
 
469 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  29.67 
 
 
469 aa  87  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  31.07 
 
 
785 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  29.25 
 
 
1168 aa  78.2  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5247  hypothetical protein  26.04 
 
 
1332 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  26.24 
 
 
957 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  35.77 
 
 
833 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  25.82 
 
 
1183 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  35.29 
 
 
986 aa  69.3  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2553  hypothetical protein  26.96 
 
 
1236 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  29.84 
 
 
1744 aa  65.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1513  hypothetical protein  22.73 
 
 
289 aa  64.7  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1678  hypothetical protein  26.52 
 
 
1235 aa  64.7  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  27.23 
 
 
503 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  28.77 
 
 
503 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0557  hypothetical protein  24.81 
 
 
1258 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000239434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  37 
 
 
843 aa  62  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0667  hypothetical protein  23.53 
 
 
1252 aa  58.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1045  hypothetical protein  21.4 
 
 
1022 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.771071  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3158  hypothetical protein  22.92 
 
 
1124 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.278506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  26.32 
 
 
814 aa  51.6  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3000  hypothetical protein  24.3 
 
 
1413 aa  49.7  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  30.71 
 
 
939 aa  49.3  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0366  hypothetical protein  25.56 
 
 
1289 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.801022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3930  hypothetical protein  20.34 
 
 
1246 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.172533  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  26.53 
 
 
1030 aa  45.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>