41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0856 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  96.42 
 
 
503 aa  966    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  995    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  33.4 
 
 
469 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  33.74 
 
 
469 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  33.27 
 
 
469 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  29.63 
 
 
1119 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  34.65 
 
 
651 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  30.87 
 
 
1101 aa  86.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  30.77 
 
 
1183 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  39.55 
 
 
1008 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  31.49 
 
 
677 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  36.54 
 
 
1168 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2889  hypothetical protein  28.23 
 
 
854 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  23.27 
 
 
1203 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  30 
 
 
986 aa  70.5  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  37.1 
 
 
833 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  31.45 
 
 
1030 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  37.59 
 
 
1744 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1814  hypothetical protein  36.17 
 
 
814 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  35.09 
 
 
706 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  34.29 
 
 
957 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  34.38 
 
 
650 aa  67.4  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1567  hypothetical protein  29.86 
 
 
843 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  31.43 
 
 
656 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  29.44 
 
 
833 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  38.46 
 
 
730 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  30.29 
 
 
647 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  32.89 
 
 
676 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  30.11 
 
 
676 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  28.99 
 
 
1088 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  26.14 
 
 
1080 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  34.19 
 
 
649 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  45.88 
 
 
737 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  34.45 
 
 
773 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  30.67 
 
 
647 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1725  hypothetical protein  36.05 
 
 
785 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000310844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  27.36 
 
 
644 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  30.59 
 
 
650 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0765  hypothetical protein  33.33 
 
 
649 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.877447  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  35.24 
 
 
760 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0923  hypothetical protein  38.32 
 
 
652 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566647  normal  0.221882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>