36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1141 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  43.65 
 
 		 986 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  100 
 
 		 1088 aa  2164    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  42.27 
 
 		 939 aa  270  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  34.64 
 
 		 833 aa  168  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  31.22 
 
 		 957 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  34.32 
 
 		 1030 aa  146  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  36.68 
 
 		 1744 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  28.32 
 
 		 469 aa  90.9  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  28.21 
 
 		 469 aa  90.1  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  28.09 
 
 		 469 aa  90.1  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1008 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  29.48 
 
 		 833 aa  89  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1119 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1183 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1203 aa  81.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1080 aa  79.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1872  hypothetical protein  39.86 
 
 		 730 aa  73.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1813  hypothetical protein  33.52 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.530677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0988  hypothetical protein  31.68 
 
 		 677 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1950  hypothetical protein  29.41 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  26.96 
 
 		 676 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1101 aa  64.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1168 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  26.98 
 
 		 676 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  28.99 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26610  conserved hypothetical protein, phage tail-like region  29.09 
 
 		 649 aa  61.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.894944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  27.01 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3825  hypothetical protein  34.46 
 
 		 706 aa  56.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150333  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5381  hypothetical protein  33.54 
 
 		 644 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1417  hypothetical protein  26.25 
 
 		 650 aa  53.5  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.677247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3046  hypothetical protein  36.94 
 
 		 760 aa  49.3  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000814337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1136  hypothetical protein  25.88 
 
 		 737 aa  48.5  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1049  hypothetical protein  30.32 
 
 		 653 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2269  Baseplate J family protein  30.9 
 
 		 647 aa  45.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260983  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  30 
 
 		 656 aa  45.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1864  hypothetical protein  25.12 
 
 		 692 aa  44.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>