26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0819 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0819  hypothetical protein  100 
 
 		 1030 aa  2045    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1489  hypothetical protein  36.59 
 
 		 833 aa  270  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.499572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0849  hypothetical protein  38.12 
 
 		 957 aa  233  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  39.48 
 
 		 1744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1141  hypothetical protein  34.32 
 
 		 1088 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1745  hypothetical protein  33.99 
 
 		 986 aa  144  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0343775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2552  hypothetical protein  32.28 
 
 		 939 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1490  hypothetical protein  28.65 
 
 		 833 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1512  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1203 aa  79  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0820  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1168 aa  72  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0987  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1119 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.365158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0666  hypothetical protein  31.85 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1813  hypothetical protein  32.04 
 
 		 792 aa  68.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.530677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3608  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1008 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.607062  hitchhiker  0.00290746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1183 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0856  hypothetical protein  31.22 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3832  hypothetical protein  25.35 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0947  hypothetical protein  25.45 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.024118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1874  hypothetical protein  24.65 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0205022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0766  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1101 aa  59.3  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1909  hypothetical protein  29 
 
 		 647 aa  55.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026445  hitchhiker  0.00137339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4392  hypothetical protein  30.35 
 
 		 656 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.642574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2814  hypothetical protein  27.03 
 
 		 676 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1666  hypothetical protein  25.7 
 
 		 676 aa  52.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1812  hypothetical protein  31.75 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1865  hypothetical protein  34 
 
 		 1080 aa  44.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>